Agua destilada e deionizada são totalmente diferentes. O processo de destilação, se faz com o aquecimento da agua e posterior resfriamento do vapor, que intitula-se agua de condensação, ou vapor condensado, que voltando ao seu estado liquido, torna-se "agua destilada". Nesse processamento a água nunca é totalmente pura, pois quando em contato com as superficies de aquecimento e resfriamento, carrega consigo partes destes materiais e se contamina. Ha ainda o consumo elevado de energia eletrica, usualmente o fonte de energia para transferir calor a agua. Agua deionizada é o produto que se tem apos a troca ionica, da agua com as resinas de troca ionica (observe que nao ocorre a filtração), os elementos quimicos cationicos e anionicos são trocados por outros elementos que nao gerem danos as superficies de contato. Não ha consumo de energia eletrica, pois a agua passa atraves de um leito granulado (tipo garos de areia), podendo ser por gravidade ou bombeamento, normalmente de fluxo descendente (de cima para baixo). Tambem nesse caso a agua nunca sera pura, pois havera a presença de microorganismos de veiculação hidrica. No entanto a "melhor agua" do ponto de vista de formação de corrosão e incrustração ( entupimentos, furos, formação de espuma, etc) é a agua deionizada, pois sua pureza ionica é superior a 95%. Uma boa configuração de um sistema inclue a presença de carvão ativado, filtro de polipropileno ( < 5 micras) e resinas de troca ionica. Fabricantes de produtos de limpeza, produtos para aquarios, cartuchos, bijouterias, consultorios odontologicos e muitos outros, podem conseguir excelentes resultados tanto economicos quanto tecnicos trocando o uso de agua destilada por deionizada. No entanto para usos especificos, por exemplo, ensaios de microbiologia, a agua destilada pode ser a melhor. Agua deionizada tem custo de produção menor em relação a destilada.